Impact de la bioinformatique : questions / réponses

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Récemment on m’a demandé quelques exemples d’impact de la bioinformatique, et avec la permission de ma correspondante, j’ai décidé de partager l’échange ici (traduit de l’anglais).

La question :

Je suis confrontée à la tâche difficile d’expliquer ce qu’est la bioinformatique tout en touchant les gens émotionnellement, si possible. Pourriez-vous me donner quelques exemples concrets et simples  – imaginez que vous parlez à votre grand-mère (non biologiste).

(Commentaire : pourquoi est-ce que quand on parle de gens qui ne comprennent pas les sciences et techniques, c’est toujours la “grand-mère” ou la “belle-mère” ? Il me semble qu’il y a un peu de sexisme là-dedans.)

a) Quels grandes avancées est-ce que la bioinformatique a permis dans la recherche en biologie ou en médecine ?

  1. Assembler et annoter le génome humain, à savoir mettre ensemble les pièces du puzzle (1 séquence brute = 1/3000000ème du génome), et faire sens de la série de lettres pour trouver les gènes, les marqueurs de maladies, les séquences régulatoires, les différences entre espèces, etc.
  2. Construire l’arbre de la vie.

b) Comment voyez-vous l’avenir de la bioinformatique et son impact sur la recherche et la société en général ?

  1. Futur de la bioinformatique et impact sur la recherche :
    • inclu dans toute la recherche en biologie, comme l’est déjà la biologie moléculaire ;
    • recherche continue dans de nouvelles directions, en raison de nouveaux défis continuels dans la génération des données, dans le type de questions posées, et dans l’échelle des données.
  2. Impact sur la société : les génomes et autres données biologiques devenant faciles et bon marché à obtenir, donner du sens à ces données, les stocker et les sécuriser, et mettre à jour en continu notres connaissance de chaque patient (voire de chaque animal de la ferme ou domestique) sera possible grâce à de la bioinformatique de qualité.

Suite à ces réponses, ma correspondante m’a demandé s’il n’y avait pas un risque d’abus de ces technologies. Ma nouvelle réponse :

Oui il y a un risque d’abus. Mais le fait est que la génomique personalisée arrive, que nous le voulions ou non. C’est comme discuter des risques de l’internet en 1995 (j’ai eu beaucoup de ces discussions à l’époque, et personne n’imaginait Facebook). Ce que nous devrions être en train de discuter est la manière d’optimiser les bénéfices et gérer les risques. Pour les deux aspects, la bioinformatique est cruciale.

Pour en rajouter un peu là-dessus : notre ADN est dans chaque cheveux que l’on perd, il est impossible d’empécher que quelqu’un puisse se procurer un échantillon de vous et le séquencer. Non seulement le prix du séquençage baisse, mais cela devient de plus en plus facile. Impossible de distinguer pour le moment l’effet d’annonce de la réalité, mais Oxford Nanopore nous promet une clé USB qui séquence un génome et met la séquence directement sur l’ordinateur, pour moins de $900. Alors il y a le coté “bienvenue à GATACA”, mais aussi le coté aller voir un nouveau médecin, et il sait immédiatement que pour vous ce médicament ça ne marche pas trop, il faut doser cet autre un peu plus fort, et vous avez un risque de réactions négatives au troisième. On va encore me dire qu’on ne sait pas grand chose juste en connaissant le génome, mais je maintiens qu’on progresse très vite là-dessus. On en saura bientôt beaucoup.

4 réponses à “Impact de la bioinformatique : questions / réponses

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